1 Настройте предпочитаемый язык интерфейса
Настройки→Язык→...

2. Если Ваш компьютер подключен к интернету - настройте автообновление программы.
Настройки→Параметры→Интернет
Подключение через Proxy (если необходимо) - уточните у системного администратора
Настройки→Параметры→Интернет→Обновления программы
Галочка «Автоматически проверять обновления» - рекомендуется включить.
Если проблем с подключением к интернету нет - выставляйте «каждые 3 дня» и «проверять при старте»
Галочка «Обновлять только до стабильных версий» -
Программа постоянно обновляется и совершенствуется. Естественно, после добавления новых возможностей - что-то может начать работать  неправильно. Какое то время в программу вносятся соответствующие коррективы. После чего, когда какое-то время сообщений об ошибках не поступает - выпускается версия объявленная «стабильной». С момента ввода новых возможностей может пройти больше месяца.
Если Вас не пугает возможность столкнутся с ошибками программы - отключайте галку «обновлять только до стабильных версий» - я буду рад вашим сообщениям об ошибках программы (точнее сказать я буду рад возможности исправить ошибки). Если эта галка отключена вы будете иметь доступ ко всем новым возможностям программы и поможете сделать программу лучше.

3. Если у вас есть достаточно быстрое подключение к интернету - установить возможность просмотра карт местности из интернета
Настройки→Параметры→Карта
Включить галочку «Показывать слои карты из интернета»
Выставьте макс. размер кэша - в зависимости от размера вашего диска. 50 мб. вполне достаточно для работы. Если вы оставите это поле не заполненным - размер кэша не будет ограничен. В таком случае контролируйте объем свободного места на диске и при необходимости удаляйте файлы кэша (для полного удаления кэша в выбранном каталоге есть кнопка «Очистить сейчас»)

4. Для того, чтобы при двойном щелчке мышью обменные файлы открывались в GeoSEE - установите ассоциации с нужными вам типами файлов в разделе Настройки→Параметры→Ассоциации с файлам
Выберите галочки с интересующими вас видами файлов. Нажмите кнопку «Применить». Если вы хотите установить ассоциации с этими файлами для всех пользователей компьютера - зайдите в программу с правами администратора, выберите нужные галочки и нажмите кнопку «Применить для всех пользователей».
Галочка «Открывать в новом окне» - если включена, то файлы будут всегда открываться в новом окне программы. Если выключена - нового окна программы, если программа запущена, открыто не будет. Если программа уже была запущена и в ней были открыты файлы - файлы будут выгружены. Если они были изменены вам будет предложено записать их или отказаться от действия.

5. Программа поддерживает различные форматы обменных файлов. Настройки распознавания форматов можно найти на закладке Настройки→Параметры→Форматы 
Здесь можно настроить систему координат по умолчанию для каждого из поддерживаемых форматов. Система координат по умолчанию будет использована при открытии файла, если в самом фале нет указания системы координат. Также при импорте обменный файл будет создан в этой системе координат. Впоследствии систему координат открытого файла можно  установить или изменить нажав правую кнопку мыши на заголовке закладки с  этим файлом и выбрав пункт «Установить систему координат» (Ctrl+W).
Также можно отказаться от распознавания субформата файла in4 и всегда открывать файлы in4 в формате утвержденном приказом ГосКомЗема от 23.05.2003. (галочка «Не распознавать субформат In4»)

6. На закладке Настройки→Параметры→Общие можно управлять следующими настройками:
·    Сколько файлов одновременно можно открыть в одном окне программы – выбор «Открывать файлы». Если выбрано «Основной+дополнительный» - в одном окне программы открывается не более двух файлов. В противном случае можно открывать любое количество обменных файлов в одном окне программы. Каждый открытый файл будет помещен на свою закладку.
·    Если в программе открыто несколько файлов – их можно сравнить для отображения изменений геометрии и семантики. Хронологический порядок в котором эти файлы участвуют в сравнении определяет выбор «При сравнении»
·    Реакцию на нажатие клавиши “Esc” определяет выбор «по клавише Esc в главном окне» - можно выбрать закрывать окно с запросом или без, сворачивать или ничего не делать
·    Ограничение на максимальное количество ошибок и предупреждений, которое выдается на разбираемый файл в панели сообщений можно установить в полях ввода «Максимальное количество сообщений при разборе обменного файла»
·    путь к файлу в формате Ntv2, в котором содержится трансформационное поле для трансформации координат из СК42 в УСК2000. При указании файла он будет проверен набором контрольных точек и в случае несовпадения результатов будет выдано предупреждение. Если файл не указан используется встроенная в программу трансформационное поле. Точность этого поля ~10см по отношению к официальному трансформационному полю.

7. Общие настройки взаимодействия с картой задаются на закладке Настройки→Параметры→Карта
·    Установить рабочую систему координат можно выбором «Рабочая система координат». Если вы открываете файлы в разных местах Украины, то для более корректного отображения рекомендуется выбрать “Пулково 42 для Украины”. Также этот выбор хорош если вы используете интернет карты – отображаться они будут быстрее. Однако минус этого выбора состоит в том, что при неправильном указании системы координат обменного файла его отображение может быть сильно искажено.
·    Программа может отображать координаты на которые указывает курсор мыши – для этого надо зажать клавишу “Ctrl”. Для того, чтобы выбрать систему координат в которой они будут отображаться – выбор «Показывать координаты». Если выбрано «В системе координат активного файла» - координаты отображаются в системе координат, которая установлена для активного обменного файла программы. Также можно выбрать «В системе координат первого файла» - координаты будут отображаться в системе первого файла открытого в программе; «В рабочей системе координат» - координаты будут отображаться в системе выбранной как рабочая на этой же закладке настроек. Для того, чтобы при нажатой клавише «Ctrl» координаты отображались над курсором мыши (а не только на панели информации) отметьте галочку «Показывать в окне над курсором»
·    При нажатии на карту с зажатой клавишей “Ctrl” программа найдет зону, участок или элемент участка по указанной точке и покажет его в правой панели, в списке объектов текущего файла. Если при этом зажата клавиша “Shift” будут выбираться элементы участка (угодья, ограничения…). По умолчанию поиск осуществляется только в текущем обменном файле. Если отмечена галочка «Поиск по точке - искать во всех открытых файлах» - сначала поиск осуществляется в текущем обменном файле. Если в нем не найдено – поиск продолжается по всем загруженным в это окно файлам. Если в одном из них нужный объект найден – этот файл становится текущим и в списке объектов обменного файла подсвечивается найденный элемент.
·    На окне карты можно показать масштабную линейку и полосы прокрутки – за это отвечают галочка «Показывать линейку масштаба карты» и выбор «Полосы прокрутки карты»
·    Галочка «Альтернативная обработка колеса мыши» отвечает за выбор способа которым использование колеса мыши влияет на окно чертежа (см Чертеж)
·    Галочка «После операции поворота участков устанавливать точность координат» дает возможность автоматически повышать точность координат (количество знаков после запятой в координатах) для обменного файла после использования инструмента «Поворачивать участки» (см Режим исправления геометрии на чертеже). Если она включена и точность координат в файле была меньше указанного числа знаков - в файле будет поднята точность координат до указанного количества знаков после запятой

8. Внешним видом карты на которой отображаются схема объектов загруженных обменных файлов можно управлять на закладке Настройки→Параметры→Карта→Стили слоев
Здесь можно установить стили для разных типов объектов обменных файлов – участков, угодий, ограничений, разных типов зон а также элементов  подсветки текущего объекта и т.п.
Полученую схему стилей можно записать, выбрав ей имя, чтобы потом иметь возможность быстро применить к объектам на карте.

9. Внешним видом текстового редактора с загруженным файлом можно управлять используя закладки
Настройки→Параметры→Редактор
Настройки→Параметры→Редактор→Цвета
На них можно указать размер и вид шрифта текста, настроить цветовую схему подсветки синтаксиса для текста обменного файла выбранного формата